Koronavīruss: mutācijas

un Christiane Fux, medicīnas redaktore Atjaunināts

Maksimiliāns Reindls studēja ķīmiju un bioķīmiju LMU Minhenē un kopš 2020. gada decembra ir redakcijas loceklis. Viņš iepazīstinās ar medicīnas, zinātnes un veselības politikas tēmām, lai tās būtu saprotamas un saprotamas.

Vairāk Maximilian Reindl ziņu

Kristiana Fuksa Hamburgā studēja žurnālistiku un psiholoģiju. Pieredzējušais medicīnas redaktors kopš 2001. gada raksta žurnālu rakstus, ziņas un faktu tekstus par visām iedomājamām veselības tēmām. Papildus darbam, Christiane Fux aktīvi darbojas arī prozā. Viņas pirmais kriminālromāns tika publicēts 2012. gadā, un viņa arī raksta, noformē un izdod pati savas noziedzības lugas.

Vairāk Christiane Fux ziņu Visu saturu pārbauda medicīnas žurnālisti.

Šobrīd delta variants no Sars-CoV-2 rada īpašas bažas ekspertiem: tas ne tikai šķiet lipīgāks, bet arī bīstamāks nekā sākotnējais savvaļas tips. Citas mutācijas ir izrādījušās vismaz lipīgākas. Šeit jūs varat uzzināt, kādas īpašības piemīt dažādām koronavīrusa mutācijām, kur tās izplatās un kāpēc vakcīnas joprojām aizsargā ļoti labi.

Mutācijas ir normālas

Jaunu vīrusu variantu parādīšanās nav nekas neparasts: vīrusi, ieskaitot patogēnu Sars -CoV -2, replikācijas laikā atkārtoti nejauši maina savu ģenētisko materiālu. Lielākajai daļai šādu mutāciju nav nozīmes. Bet daži ir labvēlīgi vīrusam un dominē.

Tādā veidā vīrusi spēj ātri pielāgoties videi un to saimniekam. Tā ir daļa no viņu evolūcijas stratēģijas.

Tomēr tikmēr ar Sars-CoV-2 ir parādījušies tā sauktie "Variants of Concern" (VoC)-tas ir, varianti, kas satrauc ekspertus. Viņiem ir kopīgs tas, ka tie ir vairāk lipīgi nekā sākotnējā Sars-CoV-2 forma.

Šie ir četri varianti:

• Alfa: līnija, kas pazīstama arī kā B.1.1.7, izplatās no Lielbritānijas.
• Beta: līnija, kas pazīstama arī kā B.1.351, izplatās no Dienvidāfrikas.
• Gamma: līnija, kas pazīstama arī kā P.1, izplatās no Brazīlijas.
• Delta: līnija, kas pazīstama arī kā B.1.617, izplatās no Indijas.

Vīrusu variācijas ir sagrupētas tā sauktajās kladēs vai līnijās - pētnieki izveido sava veida “koronavīrusa ciltskoku”. Katru variantu raksturo pēc ģenētiskā sastāva un tam piešķir burtu un ciparu kombināciju. To, vai kāds vīrusa celms ir bīstamāks, nevar noteikt pēc šī apzīmējuma - to izmanto tikai sistemātiskai reģistrēšanai un dokumentēšanai.

Starp citu: Pasaules Veselības organizācija (PVO) nesen ieteica ieviest jaunus nosaukumus svarīgākajiem Sars-CoV-2 variantiem. Saskaņā ar PVO datiem atsevišķi vīrusu varianti tagad jānosauc augošā secībā saskaņā ar grieķu alfabētu.

Šis jaunais, vienkāršāks un galvenokārt neitrāls apraksts ir paredzēts, lai novērstu jaunu vīrusu variantu pielīdzināšanu to pirmās atklāšanas vietai. Tas paredzēts, lai novērstu nepamatotas un zinātniski nepamatotas stigmas, diskrimināciju un aizspriedumus pret atsevišķām valstīm publiskās debatēs.

Visticamāk. Pētījums no Skotijas, kas publicēts prestižajā žurnālā The Lancet, liecina, ka risks slimnīcā ārstēties ar Delta infekciju ir divreiz lielāks nekā sākotnējā variantā.

Vai vakcinācija aizsargā pret Delta variantu?

Jā. BioNTech / Pfizer aizsargā 79 procentus no slimībām pret Delta pēc otrās vakcinācijas devas, salīdzinot ar 92 procentiem pret alfa variantu, kas sākotnēji tika atklāts Lielbritānijā. Pēc vakcinācijas ar AstraZeneca aizsardzība pēc otrās vakcinācijas devas ir 60 procenti, salīdzinot ar 73 procentiem.

Šie skaitļi attiecas uz viegliem un vidēji smagiem simptomu kursiem. Netiek ņemts vērā, cik labi vakcinācija aizsargā pret smagām slimībām un nāvi. Bet tieši šeit aizsardzības pakāpe varētu būt ievērojami labāka.

Delta vīruss - imunoloģiskie fakti

Koronavīrusa delta variants (B.1.617) pirmo reizi tika atrasts Indijā. Tas parāda trīs apakšvariantus un apvieno vairākas raksturīgas izmaiņas. Šāda saišķēšana pirmo reizi tika demonstrēta vīrusa variantā.

No vienas puses, šīs ir izmaiņas smailes proteīnā, kas tiek uzskatīts par cilvēka šūnas “atslēgu”. No otras puses, B.1.617 parāda arī izmaiņas, kas tiek apspriestas kā (iespējama) glābšanās mutācija.

Konkrēti, B.1.617 apvieno šādas attiecīgās mutācijas:

Mutācija D614G: tas var padarīt koronavīrusu lipīgāku. Sākotnējā modelēšana norāda, ka B.1.617 tiek pārraidīts vismaz tikpat viegli kā ļoti lipīgais alfa variants (B.1.1.7).

Mutācija T478K: Tas noved pie neuzlādētas aminoskābes treonīna apmaiņas ar lizīnu 478. pozīcijā, protonēts fizioloģiskos apstākļos - un tādējādi pozitīvi uzlādēts. Tiek pieņemts, ka šī aminoskābju apmaiņa ietekmē mijiedarbību ar ACE2 receptoru. Ekspertiem ir aizdomas, ka tas varētu izraisīt smagākas Covid-19 slimības.

Mutācija P681R: Pētnieki to arī saista ar iespējamu paaugstinātu virulenci.

Mutācija E484K: tika konstatēts arī beta variantā (B.1.351) un gamma variantā (P.1). Ir aizdomas, ka vīruss kļūst mazāk jutīgs pret jau izveidotajām neitralizējošajām antivielām.

Mutācija L452R: Tas tiek apspriests arī kā iespējamā glābšanās mutācija. Laboratorijas eksperimentos koronavīrusa celmi ar L452R mutāciju bija daļēji izturīgi pret noteiktām antivielām.

Citi zināmi vīrusu varianti

Turklāt tika izstrādāti papildu Sars-CoV-2 vīrusa varianti, kas atšķiras no savvaļas tipa, taču eksperti tos pašlaik neuzskata par GOS. Šos vīrusu celmus sauc par "interesējošiem variantiem" (VOI) - tas ir, par īpaši interesējošiem variantiem.

Vēl nav skaidrs, kādu ietekmi šie jaunie VOI varētu atstāt uz pandēmiju. Ja tie izturētu pret vīrusu celmiem, kas jau ir apritē, arī tos varētu uzlabot līdz atbilstošiem GOS.

Īpaši interesanti varianti

Saskaņā ar Eiropas Slimību profilakses un kontroles centra (ECDC) datiem, šie VOI pašlaik ietver:

• Eta: pierādīts daudzās valstīs (B.1.525)
• Iota: pirmo reizi atklāts ASV Ņujorkas apgabalā (B.1.526)
• Kappa: pirmoreiz atklāts Indijā (B.1.617.1)
• Lambda: pirmo reizi atklāta Peru (apm. 37)

Turklāt saskaņā ar ECDC datiem ir vēl daži VOI, kas vēl nav aprakstīti saskaņā ar jauno PVO nomenklatūru:

• B. 1620 nezināmas izcelsmes.
• B. 1621 pirmo reizi atklāts Kolumbijā.

Saskaņā ar ECDC un PVO informāciju iepriekš minētie varianti kā epsilons, zeta un teta vairs nav VOI sastāvdaļa. Variants B.1.616, kas pirmo reizi tika atklāts Francijā, arī ilgi cirkulēja, būtiski neietekmējot pandēmiju.

Varianti novērošanā

Paplašinātā uzmanība tiek pievērsta arī tā sauktajiem "pārraudzībā esošajiem variantiem" (VUM) - tomēr par tiem joprojām trūkst ticamu, sistemātisku datu. Lielākoties ir tikai pierādījumi par to tukšo eksistenci. Tajos ietilpst sporādiski sastopami varianti vai "modificēti" - vai, labāk sakot, tālāk attīstīti - jau zināmu mutāciju pēcteči.

Saskaņā ar ECDC datiem šajos retajos VUM pašlaik ietilpst:

• B.1.427 un B.1.429 - PVO iepriekš to dēvēja par Epsilon, tagad pazemināta, vispirms atklāta Kalifornijā.
• P.2 - PVO agrāk to dēvēja par Zeta, tagad pazemināta, vispirms atklāta Brazīlijā.
• P.3 - PVO iepriekš to dēvēja par tētu, tagad pazemināta, vispirms atklāta Filipīnās.
• B.1.214.2, A.27, A.28, C.16 un B.1.1.318 - nezināmas izcelsmes varianti.
• Citi varianti, kas pirmo reizi tika atklāti Dienvidāfrikā: B.1.351 + E516Q un B.1.351 + P384L, C.1.2
• Citi varianti, kas pirmo reizi tika atklāti Lielbritānijā: B.1.1.7 + L452R un B.1.1.7 + S494P, A.23.1 + E484K, AV.1, B.1.671.2 + K417N
• Citi varianti, kas pirmo reizi tika atklāti ASV: B.1.526.1, B.1.526.2
• Variants, kas pirmo reizi tika atklāts Krievijā: AT.1
• Variants, kas pirmo reizi tika atklāts Ēģiptē: C.36 + L452R
• Variants, kas pirmo reizi tika atklāts Meksikā: B.1.1.519

Lai gan šobrīd ir zināms liels skaits jaunu vīrusu variantu, tas automātiski nenozīmē lielākus draudus. Šobrīd riska novērtējums vēl nav iespējams. Nevar paredzēt arī šī VUM ietekmi uz (globālo) infekcijas procesu. Tātad, vai daži vīrusu varianti ir būtiski vai bīstami, to var noskaidrot tikai ar turpmākiem novērojumiem.

Cik bīstamas ir koronavīrusa mutācijas?

Saskaņā ar pašreizējām zināšanām koronavīrusa mutācijas, kas oficiāli klasificētas kā "bažas varianti", ir bīstamākas nekā savvaļas koronavīrusa veids. Tie ir ļoti lipīgi, un to piemērotās izmaiņas (glābšanās mutācijas) var veicināt sekundāras infekcijas.

Tomēr nav viegli veikt vispārēju novērtējumu par to, vai citas koronavīrusa mutācijas ir bīstamākas nekā sākotnējais Sars-CoV-2 patogēns. Trūkst pieredzes un stabilas datu bāzes, it īpaši ar jaunizveidotajiem variantiem.

Ko nozīmē augstākā lipīgā jauda?

Ja Sars-CoV-2 kļūs lipīgāks, būs arī grūtāk apturēt tā izplatīšanos. Pasākumi, kas līdz šim veiksmīgi ierobežoja izplatību, tad varētu vairs nepietikt.

Ja, piemēram, vīrusa savvaļas formas replikācijas vērtība R tiek samazināta līdz 0,8 un inficēto cilvēku skaits pakāpeniski samazinās, vīruss, kas ir par 35 procentiem vairāk lipīgs, izplatītos tālāk un sāktu infekcijas ķēdes, ja tika veikti tādi paši pasākumi.

Ko tas nozīmē vakcīnām?

Uz to nav vispārējas atbildes. Iespējamo samazināto jaunizveidoto vakcīnu aizsargājošo efektu aktīvi apspriež speciālistu aprindās. Līdz šim vakcīnu ražotāji un sākotnējie izmeklējumi šajā sakarā ir devuši visu skaidro.

Piemēram, Comirnaty sākotnējos pētījumos parāda salīdzināmu efektivitāti salīdzinājumā ar alfa variantu (B.1.1.7) un beta variantu (B.1.351). Šķiet, ka arī VaxZevria nodrošina labu aizsardzību sadaļā B.1.1.7, bet efektivitāti pret līniju B.1.351 varētu samazināt.

Tas, cik lielā mērā pārējās Moderna un Johnson & Johnson vakcīnas izturēs pret modificētajiem vīrusu variantiem, vēl nav galīgi noskaidrots.

Kad vīruss progresē, var būt nepieciešama vakcīnas pielāgošana. Tomēr, ņemot vērā progresu vakcīnu izstrādē, to var izdarīt īsā laika periodā. Tomēr visas Eiropas Savienībā apstiprinātās vakcīnas joprojām nodrošina efektīvu un adekvātu aizsardzību - īpaši pret smagiem un letāliem Covid -19 kursiem.

Plašāku informāciju par koronavīrusa vakcīnu tēmu var atrast šeit.

Cik ātri Sars-CoV-2 mutē?

Nākotnē Sars-CoV-2 mutāciju rezultātā turpinās pielāgoties cilvēka imūnsistēmai un (daļēji) vakcinētai populācijai. Cik ātri tas notiek, lielā mērā ir atkarīgs no aktīvi inficēto iedzīvotāju skaita.

Jo vairāk inficēšanās gadījumu - reģionālo, nacionālo un starptautisko - jo vairāk koronavīruss vairojas, un jo biežāk notiek mutācijas.

Tomēr, salīdzinot ar citiem vīrusiem, koronavīruss mutē salīdzinoši lēni. Ar kopējo Sars-CoV-2 genoma garumu aptuveni 30 000 bāzes pāru, eksperti pieņem vienu līdz divas mutācijas mēnesī. Salīdzinājumam: Gripas vīrusi tajā pašā periodā mutē divas līdz četras reizes biežāk.

Kā es varu pasargāt sevi no koronavīrusa mutācijām?

Jūs nevarat īpaši aizsargāties pret atsevišķām koronavīrusa mutācijām - vienīgā iespēja ir neinficēties.

Parasti ievērojiet higiēnas noteikumus, ievērojiet distanci un publiski valkājiet FFP2 masku. Ja jūs vakcinēsities, jums būs arī laba pamata imunitāte pret smagiem kursiem.

Kā tiek atklātas koronavīrusa mutācijas?

Vācijā ir cieša ziņošanas sistēma, lai uzraudzītu cirkulējošos Sars-CoV-2 vīrusus-to sauc par "integrētu molekulārās uzraudzības sistēmu". Šim nolūkam attiecīgās veselības aizsardzības iestādes, Roberta Koha institūts (RKI), specializētās diagnostikas laboratorijas un Berlīnes Charité koronavīrusu konsultāciju laboratorija cieši sadarbojas.

Kā darbojas ziņošanas sistēma, ja ir aizdomas par mutāciju?

Pirmkārt, katram profesionāli veiktam pozitīvam koronavīrusa testam ir jāziņo atbildīgajai veselības iestādei.Tas ietver koronavīrusa testus, kas tika veikti testu centrā, pie ārsta, aptiekā vai valsts iestādēs, piemēram, skolās. Tomēr privātās pašpārbaudes no tā ir izslēgtas.

Plašāku informāciju par koronavīrusa ātrajiem testiem personīgai lietošanai varat atrast mūsu tēmā Īpašie koronavīrusa pašpārbaudes testi.

Ja rezultāts ir pozitīvs, ārsti nosūta atbilstošo pacienta paraugu uz specializētu diagnostikas laboratoriju, kas apstiprina rezultātu, izmantojot PCR testu. Ja arī PCR tests ir pozitīvs - paraugu var nosūtīt arī uz sekvencēšanas laboratoriju, kur to var tālāk pārbaudīt (sekvencēšanas genoma analīze).

Pēc tam RKI salīdzina ziņošanas datus un secības analīzes rezultātu pseidonimizētā veidā. Pseidonimizēts nozīmē, ka nav iespējams izdarīt secinājumus par vienu personu. Tomēr šī informācija veido datu bāzi zinātniekiem un ieinteresētajām personām veselības aprūpes sistēmā, lai iegūtu precīzu pārskatu par pašreizējo pandēmijas situāciju. Tas ļauj vislabāk novērtēt situāciju, lai (ja nepieciešams) iegūtu politiskus pasākumus.

Kas ir sekvencēšanas genoma analīze?

Sekvencēšanas genoma analīze ir detalizēta ģenētiskā analīze. Viņa pārbauda precīzu atsevišķu RNS komponentu secību vīrusa genomā. Tas nozīmē, ka Sars-CoV-2 genoms, kas satur aptuveni 30 000 bāzes pāru, ir atšifrēts un pēc tam to var salīdzināt ar koronavīrusa savvaļas tipa genomu.

Tikai šādā veidā atsevišķas mutācijas var atpazīt molekulārā līmenī - un iespējama piešķiršana "koronavīrusa ģimenes kokā".

Genoma sekvencēšana ir laikietilpīgs un dārgs process ar (ļoti) ierobežotām iespējām. Tātad ne katru pozitīvo paraugu var regulāri sekvencēt. Eksperti veic priekšatlasi - tāpēc viņi ņem paraugu.

Tas arī skaidri parāda, ka ne katra pasaules valsts spēj detalizēti izsekot konkrētu koronavīrusa variantu precīzai izplatībai. Tāpēc ir iespējams, ka pieejamie ziņošanas dati zināmā mērā ir neskaidri.

Tagi:  zobu aprūpe gpp sporta fitnesa